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粪菌移植有彻底治愈便秘的可能，粪菌移植是提取健康人粪便中的相关功能菌群，并移植入患者的胃肠道中，重新建立出新型肠道菌群，从而使肠道内外症状得以控制的一种措施。近年来，将粪菌移植应用到功能性便秘的治疗中取得了较好的疗效，但需要的技术要求较高，尚未大规模开展。
便秘分为器质性便秘和功能性便秘。器质性便秘往往是由大肠及肛门肿瘤、大肠及肛门炎症、直肠痉挛等因素引起。而功能性便秘则通常是由精神神经因素、胃肠蠕动减慢、肠道刺激不足、排便无力、肠道菌群失调等因素引起。
对于器质性病变应该采取对因治疗，才能有效治疗便秘的症状。对于功能性便秘则需要患者通过调节日常饮食和习惯才能缓解症状。如多吃清淡的食物以及粗粮制品，少吃辛辣油腻的食物；日常加大饮水量，使大便变得湿润；避免熬夜，形成早睡早起的习惯等，只有这样才能帮助改善便秘。
如果患者反复出现便秘的症状，那么应及时到正规医院就诊，在专业医生的指导下对症用药，以免延误病情，造成严重后果。