直肠炎是一种趋向于对传统和自然疗法结合的十分敏感的病症。由于外科手术会带来的潜在的并发症，所以一般选择非外科手术的疗法来治疗直肠炎。然而，一些特定的疗法取决于引起直肠炎病症的原因。所以我们可以大肠水疗的方法。
大肠水疗系统，通过结肠透析，在肠腔内建立有效的治疗场，利用结肠自身潜在的吸收和排泻功能，清除肠 腔内和肠黏膜上的有害代谢产物和毒素，配合针对性中药煎制的溃结汤。
在使用大肠水疗仪清洗结肠、排空肠道后，将其经该机微泵注入结肠，并在肠内保留药液4小时以上。经过治疗后患者临床症状消失，大便常规检查 正常，肠镜检查肠黏膜病变恢复正常，从而达到治愈的目的。
当然我们看也可以从严重程度选择方法治疗。
一、一般治疗 急性发作期，特别是重型和暴发型者应住院治疗，及时纠正水与电解质平衡紊乱，待病情好转后酌情给予流质饮食或易消化、少纤维、富营养饮食。
二、水杨酸偶氮磺胺类药物 一般用水扬酸偶氮磺胺吡啶(简称SASP)作为首选药物，适用于轻型或重型经肾上腺糖皮质激素治疗已有缓解者，疗效较好。
三、肾上腺糖皮质激素 适用于暴发型或重型患者，可控制炎症，抑制自体免疫过程，减轻中毒症状，有较好疗效。常用氢化考地松，或地塞米松每日静脉滴注，疗程7-10天，症状缓解后改用强的松龙口服，病情控制后，递减药量，停药后可给水杨酸偶氮磺胺吡啶，发免复发
四、水苏糖 对于慢性直肠炎的后期恢复，水苏糖能起很大的作用。水苏糖是膳食纤维的一种，它不但可以增加有益菌，而且还可以增强胃肠道定点的防抗能力。尤其是 病情时间长，用药历史久的朋友，可能对其他药物有较强的耐药性，用药过多后(尤其是消炎药)，能迅速增殖肠道有益菌，使菌群能黏附于人体肠道内，形成一层 厚厚的菌群膜，抵御致病菌，有效的阻止肠毒素的侵害。
一般治疗
一、直肠炎调理
病人适当休息，进清淡、少渣、营养丰富、无刺激性的食物，并做到心情愉快，劳逸结合。
二、直肠炎全身治疗
1.抗生素治疗
可根据病情口服、肌注或静滴抗生素。
2.中药理气舒肠方治疗
1)慢性期体虚无力
以排粘液为主。常用方剂有：太子参、炙黄芪、白术、甘草、罂栗壳、白芍、石榴皮、明矾，水煎内服，1日2次。
2)慢性直肠炎急性发作
予以清热解毒、润肠通便。里急后重，便次多者用枳实导滞丸清理荡积。
三、直肠炎局部治疗
1.直肠粘膜水肿
可用生理盐水、鞣酸、高锰酸钾溶液灌洗直肠。粘膜糜烂者，可涂醋酸可的松溶液或硝酸银溶液。括约肌、肛提肌痉挛者，可将温橄榄油注入直肠内。直肠粘膜萎缩变干者，可每晚于直肠内注入薄荷油适量。临床上，用蜂蜜、芝麻油和黄霉液，隔一天交替保留灌肠，每天2次，有很好的疗效。
2.建议
对直肠炎长期患者或反反复复的患者，建议可以采用中药理气舒肠方进行治疗，同时注意一下饮食习惯。
四、直肠炎用药水
1.杨酸偶氮磺胺类药物
一般用水扬酸偶氮磺胺吡啶(简称SASP)作为首选药物，适用于轻型或重型经肾上腺糖皮质激素治疗已有缓解者，疗效较好。
2.肾上腺糖皮质激素
适用于暴发型或重型患者，可控制炎症，抑制自体免疫过程，减轻中毒症状，有较好疗效。常用氢化考地松，或地塞米松每日静脉滴注，疗程7-10天，症状缓解后改用强的松龙口服，病情控制后，递减药量，停药后可给水杨酸偶氮磺胺吡啶，以免复发。
直肠炎最主要是局部外用给药或者保留灌肠，还可根据情况配合中药内服。患者应到正规的肛肠医院取药。所取药物种类有，西米替丁、锡类散、加上氧氟沙星或者甲硝唑(这两个交替灌肠)灌肠治疗。禁忌辛辣刺激、油腻、生冷食物。