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这是很多发热待查病人常常问的一个问题，一般来说需要住院诊治的发热待查病人是指在门诊根据病程、体温、既往病史，已经完善了系统性的全面检查之后，仍然不能确诊的患者。系统全面的检查一般包括，血常规、尿常规、大便常规，加隐血、肝功能、肾功能、电解质、外周血涂片、甲状腺功能、乳酸脱氢酶、肌酸激酶、血糖、血培养，一般血培养要在不同的部位做三套，中段尿培养加菌落计数，降钙素原、DIC全套，以及血沉、C反应蛋白、铁蛋白、免疫固定电泳、免疫球蛋白、淋巴细胞亚群、自身抗体谱、肿瘤标志物、艾滋、梅毒、心电图、腹部B超、全身浅表淋巴结的超声、胸部的CT平扫，这些检查一般在门诊是可以完成的，这些检查也称为发热待查第一阶段的筛查。
住院的病人一般是进入第二阶段，是在第一阶段可以找到一些潜在的诊断线索，然后选择进一步做一些特异性的检查，所以第二阶段的检查比较复杂，而且费用比较昂贵，一般建议住院期间才做的。在这些诊断的线索引导下，做一些特异性的有创检查。
发热待查的病人伴有淋巴结肿大，可以做淋巴结的活检，淋巴结活检是一个有创检查，它虽然有创伤，但是可以获得特异性的结果。另外，根据获得一些发热待查的线索可以做一些全面的影像检查，比如PET-CT，在诊断困难的病例中，必要的时候可以多次重复的做有创检查，以获取临床线索。
