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EB病毒DNA对临床确诊EB病毒感染较EB病毒抗体意义更大。
EB病毒感染确诊的直接依据就是在血液、唾液等标本中发现EB病毒DNA，检测方法是分子生物学方法，主要通过PCR等技术检测，EB病毒DNA阴性，基本排除EB病毒感染，所以说EB病毒DNA临床意义比较大。
EB病毒抗体检测在临床上有一定的局限性，在发病的急性期，可能不能检测出抗体，并且抗体分IgG抗体和IgM抗体，急性感染期一般IgM为阳性，疾病好转后转阴，而IgG抗体主要提示既往感染，若双份血清检测发现IgG抗体滴度在4倍以上也提示EB病毒近期感染，感染EB病毒后IgG可长期存在。
综上所说，在临床上两者各有优势，但对于EB病毒感染的确诊，DNA的意义更大。