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原发性肝癌的临床病象极不典型，其症状一般多不明显，特别是在病程早期,所以要确诊肝癌需要通过一些仪器和设备才能完全确定。
血液生化检查
血液生化检查对于原发性肝癌的判断有一定的临床意义，因为原发性肝癌患者的血液中可能出现血液碱性磷酸酶、谷草转氨酶、乳酸脱氢酶或胆红素升高、白蛋白降低等肝脏功能改变以及淋巴细胞亚群等免疫指标的改变。
肿瘤标志物检查
AFP(甲胎蛋白)是肝癌的检查中最好的肿瘤标记，如果甲胎蛋白400ng/mL一个月，或AFP200ng/mL持续二个月，排除妊娠和生殖腺胚胎癌者，高度警惕肝癌。
腹部超声扫描
腹部超声扫描确诊肝癌的最直接的依据，术中超声可以发现小病灶及判断肿瘤与血管的关系，超声导引下穿刺活检可以直接获取组织学诊断。
CT检查
CT检查是目前诊断和鉴别诊断肝癌的重要方法，主要用来观察肝癌形态及血供状况、肝癌的检出、定性、分期以及肝癌治疗后复查。
磁共振检查
磁共振检查是肝癌影像诊断的有力补充，磁共振平扫组织分辨率高，可对病变的内部结构进行分析，增强扫描可了解肿瘤的血供情况，平扫与增强扫描结合更有助于肝癌的诊断。
病理学检查
这种肝癌的检查是腹腔镜和经皮细针穿刺活检，一般不作为常规检查手段，只有在有适应证的情况下，可在有条件的医院或上级医院分别采用以协助诊断。（明确诊断的金标准）
同位素检查
目前有一个先进的检查仪器PET-CT，可以对于肝癌的情况做出一个比较真实的诊断。PET-CT对于肝癌本身的敏感性不如前面那几个敏感(低），但是对于转移癌的敏感性是很高的，我们发现有的肝癌病人可能已经有转移了，有淋巴结转移了，有其它脏器的转移，有骨转移，这个时候PET-CT是很好的检查手段。