埃博拉病毒是引起人类和灵长类动物发生埃博拉出血热的烈性病毒，感染者症状与同为纤维病毒科的马尔堡病毒极为相似，包括恶心、呕吐、腹泻、肤色改变、全身酸痛、体内出血、体外出血、发烧等。
起病急，发热、极度虚弱、肌肉疼痛、头痛和咽喉痛属于典型症状和体征。随后会出现呕吐、腹泻、皮疹、肾脏和肝脏功能受损，某些情况下会有内出血和外出血。
发病后的两星期内，病毒外溢，导致人体内外出血、血液凝固、坏死的血液很快传及全身的各个器官，病人最终出现口腔、鼻腔和肛门出血等症状，患者可在24小时内死亡。
由于许多症状并非埃博拉病人独有，所以是否感染该病毒只有通过实验室检验才可确认。埃博拉病毒的潜伏期为2至21天，在潜伏期间不具有传染性。致死原因主要为中风、心肌梗塞、低血容量休克或多发性器官衰竭。