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导致牙龈炎的原因有，一个是堆积在牙颈部及龈沟内的牙菌斑中的微生物，菌斑的微生物及其产物可以长期作用于牙龈，导致牙龈的炎症反应。此外还有一些其它局部因素，譬如牙结石、不良的修复体以及食物嵌塞、牙齿的错位拥挤，还有口呼吸等，都可以加重菌斑的堆积，加重牙龈炎症。此外，体内激素的改变，譬如青春期、妊娠期的激素水平升高，也可以加重牙龈的炎症。
另外，口腔黏膜方面的疾病，譬如天疱疮、类天疱疮、扁平苔藓等，它也会引发牙龈，或者在牙龈上有一个相关的疾病的表现。还有血液性的疾病，比如白血病、血小板减少性紫癜、血友病、再生障碍性贫血，也会在牙龈上有相关的临床表现。另外就是hiv，有一些譬如hiv患者，会有一些牙龈的炎症表现，比如线性红斑等。
牙龈炎反复发作的根本原因，在于病因没有得到彻底的解决，口腔是一个细菌多量多样性的复杂生态环境，机体的抵抗力强的时候或者譬如使用抗菌药物时，有一些有害菌群的生长它可以得到抑制，炎症会暂时控制。但是一旦机体抵抗力差的时候，有害的菌群就会大量繁殖，引发牙龈炎症。
