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核磁共振是继CT后医学影像学的又一重大进步，它能够应用于很多疾病的检查：
一、神经系统病变：比如脑梗死、脑肿瘤、炎症、变性病变、脑先天畸形、外伤等，为应用最早的人体系统，目前积累了丰富的经验，对病变的定位、定性诊断较为准确，可发现早期病变。
二、心血管系统：可用于心脏病、心肌病、心包肿瘤、心包积液以及附壁血栓、内膜片的剥离等的诊断。
三、胸部病变：纵隔内的肿物、淋巴结以及胸膜病变等。
四、腹部器官：肝癌、肝血管瘤及肝肿瘤的诊断与鉴别诊断，腹内肿块的诊断与鉴别诊断，尤其是腹膜后的病变。
五、 骨与关节：骨内感染、肿瘤、外伤的诊断与病变范围。
六、盆腔脏器：子宫肌瘤等其他肿瘤，直肠、前列腺和膀胱的肿物等。
七、全身软组织病变：无论来源于神经、血管、淋巴管、肌肉、结缔组织的肿瘤、感染、变性病变等，皆可做出较为准确的定位、定性的诊断。
