湘雅医院胃肠外科是普通外科的一部分，专科成立于2004年，在临床医疗、教学、科研方面具有雄厚的技术力量，是省内规模最大的学科之一，为中国抗癌协会胃肠肿瘤培训示范基地之一。学科设有一个专科病房，病床数54张，年收治住院病人2000人次，年门诊量达20000余人次。有博士导师3人、正副高级职称7人、主治医师5人，主管护师3人、护师4人、护士13人。主治以上职称均具博士以上学历，每年带教博士生和研究生8-10人。
本专科开设有胃肠道肿瘤、肛肠疾病、肠瘘、肠内外营养、家族性腺瘤性肠息肉疾病、炎性肠病的外科治疗等门诊，病房常年设置一支专业技术力量雄厚、责任心强的医护队伍，多年来开展以病人为中心的整体医疗护理服务，医护人员在各自岗位上认真履行职责，坚持科主任、教授、主治医师、住院医师、护士长分级查房制度，为病人的正确诊断、合理治疗和护理提供了根本保证，满足了病人身心需要，深受广大患者好评。科室配备有肛肠疾病门诊手术室，拥有腹腔镜、电子结肠镜、肛肠治疗仪等先进设备。临床治疗主要是胃肠道外科疾病、胃肠及腹腔肿瘤、肛肠疾病、腹腔镜手术等，其中胃癌手术、结肠癌手术、低位直肠保肛手术、胃肠道腹腔镜手术、吻合器痔切除手术达到国内先进水平。
胃肠外科主要研究方向是致力于胃肠道肿瘤的多学科治疗及规范化手术推广、微创外科在胃肠疾病（包括胃肠道良、恶性肿瘤）的应用、肠瘘和肛肠疾病的综合治疗、痔病的无痛治疗等。每年开展各类胃肠道肿瘤根治手术数八百余例，居于省内前列。同时己广泛开展腹腔镜胃癌、结直肠癌根治手术。其中全结肠切除、微创腹腔镜治疗胃肠道肿瘤、腹腔镜辅助上腹联合脏器切除等技术达国内领先水平。
本专科从上世纪70年代开始开展静脉营养与肠内营养的临床应用和实验室研究，率先对手术营养不良、短肠综合征、肠瘘及危重病人进行了营养支持治疗的研究。根据病情及需要，设计营养素齐全，符合生理要求的治疗饮食，使患者能够得到补偿消耗、恢复体力、降低分解、促进合成，维持机体内环境的稳定，促进伤口愈合，使机体能早日康复。并作为湖南省医学会普通外科肠内、肠外营养专业学组的挂靠科室，承担着指导湖南省其他医院肠内肠外营养支持的治疗工作，也促使营养支持治疗上了一个新台阶。
该科在科研方面频出成果，获科研课题15项，其中国家自然科学基金课题3项，获部省级10项，发表论文百余篇，其中SCI论文20余篇。
专科特色：胃肠外科成立于2004年，一直坚持走专科化发展的道路，对相关胃肠道疾病如胃肠道肿瘤的综合诊治、肠瘘的防治、炎症性肠病的外科处理、慢性便秘的外科处理、肛周常见疾病的处理等方面开展了卓有成效的工作，重点对胃肠道间质瘤的综合诊治、胃癌、大肠癌的规范化治疗、家族性腺瘤性息肉病的处理、肠瘘的综合诊治等方面开展了一系列的临床及相关研究工作，并取得了令人满意的成绩。
1、胃癌、结直肠癌的规范化治疗
胃癌、结直肠癌是我国最为常见的恶性肿瘤之一，也是本科收治的最常见病种之一。如何提高其疗效和改善患者的生活质量一直是我们努力的方向和追求的目标。逐步建立和规范了以外科为主的胃癌、结直肠癌多学科规范化综合诊治体系（包括胃癌、结直肠癌多学科团队的讨论、规范化的胃癌D2根治、结直肠癌的全系膜切除、各种不同术式应用于低位直肠癌的保肛手术等），让患者能够享受到国内先进的医疗服务和良好的治疗效果，使患者的5年生存率和生活质量得到进一步的提高。同时建立并不断完善了胃癌和结直肠癌的病例管理和病人随访制度(目前已做到对胃肠道肿瘤患者90%以上的随访登记率)。自2011年以来，开始制定和实施了胃癌临床路径，使治疗更加规范化、专业化。本科近3年开展各种术式治疗胃癌1812例（其中腹腔镜下胃癌根治、全胃切除107例）、结直肠癌2521例（其中腹腔镜下结直肠癌根治、全结肠切除513例），手术例数居湖南省各医院之首。
2、胃肠道间质瘤的综合诊治
早在上世纪90年代初期，我科在国内首先认识了胃肠道间质瘤这一长期被“误认“的疾病，并建立和逐渐完善了胃肠道间质瘤的长期诊治制度，做到对每例患者进行登记、定期随访追踪，也是国内最早开展胃肠道间质瘤手术+靶向治疗+随访制度的科室之一。在此基础上，建立了胃肠道间质瘤的临床信息管理系统，保存了大量的病例资源，为后续的科学研究提供了大量的、珍贵的组织标本、临床病理和预后资料。在特殊部位（十二指肠、直肠)间质瘤的术前辅助治疗和采取不同术式，以及靶向治疗的少见不良反应方面积累了丰富的经验。71例不能手术及转移复发患者经服用靶向药物后再手术治疗，无进展生存（PFS）68.3月，5年生存率67.6%。
3、家族性腺瘤性息肉病等的综合诊治
上世纪80年代后期我们率先在国内开展全结肠切除+直肠粘膜剥除+回肠储袋-肛管吻合法（IPAA）治疗FAP（以往多行回肠造口或回直肠吻合），IPAA占全部病例的 78.9%，并著文向国内介绍。对防止腺瘤残存恶变及改善患者生活质量方面，起了很大的作用，排便次数7.14±1.28（5-11）次/24小时。此后又不断改良术式，废除直肠肌鞘，用双吻合器法行超低位吻合，免去预防性回肠造口。对十二指肠腺瘤和恶性病变的处理，对腹腔、腹壁硬纤维瘤的手术/药物治疗,对腺瘤的NSAID药物治疗，积累了丰富经验。近年来又采用腹腔镜辅助手术。对患者建立长期随访，重视诊断和处理肠外病变。我们还在国内率先开展了APC基因截短蛋白检测（TPT）。
4、肠瘘的综合诊治
肠瘘尤其是高位肠瘘、多处复杂肠瘘一直是胃肠领域的治疗难点。我科在国内较早开始使用肠外、肠内营养及充分引流来治疗肠瘘，随着营养制剂和营养治疗观念的改变、引流及手术技术的改进、药物的丰富，肠瘘治疗的有效率已大有提高，近年来更是随着造口护理技术的改进，肠瘘的治疗成功率大为提高，近3年治疗130余例，成功率达70%以上。
获奖情况：
1. “应用蛋白质组学方法研究大肠癌转移相关蛋白“获2009年湖南省科技进步三等奖；
2. “胃癌侵袭转移的分子机制研究“获2011年湖南省自然科学三等奖；