肝胆胰外科为普通外科学中重要的亚专业之一。南昌大学第二附属医院肝胆胰外科是江西省肝胆胰外科专业的发源地，我省第一台胆囊切除术、胆道探查术、肝切除术、胰十二指肠切除术、胆肠吻合术、原位肝移植、再次肝移植、背驼式肝移植、腹腔镜肝切除术、腹腔镜胰十二指肠切除术、腹腔镜胆肠吻合术、经内镜自然腔道胆囊切除术等均由本科室完成。本科室现包含4个病区，开放床位186张，年手术量已达3000余台,是江西省规模最大、临床及科研实力最强的肝胆胰疾病外科诊治中心，是江西省医学领先学科，江西省医学领先学科省市共建项目第一批、第二批援建单位，是江西省肝胆外科学组、江西省腹腔镜（普外）质量控制中心主任委员单位，是江西省肝胆外科疾病诊疗中心挂靠单位。肝胆胰外科拥有江西省肝胆疾病工程技术研究中心及江西省腹腔镜（普外）培训基地两个临床技术、基础理论及转化医学研究平台。

医院肝胆胰外科建科以来，在肝胆胰疾病的以手术为主的综合诊治技术及微创诊疗技术方面在省内处于领先地位。尤其是在肝胆胰肿瘤疾病中，本学科在手术为主的规范化综合诊治、微创技术的规范化应用以及分子生物学机制研究方面有自己独到的特色。近年来，在省内率先实施解剖性肝切除术、腹腔镜肝切除术、联合血管切除的胰十二指肠切除术、经脐单孔腹腔镜手术、腹腔镜下胆肠吻合术、腹腔镜胰十二指肠切除术、保留脾脏的腹腔镜胰体尾切除术、经自然腔道内镜外科等肝胆胰外科高难度手术。其中Ｇｌｉｓｓｏｎ蒂横断式解剖性肝切除术解剖性肝切除术、腹腔镜肝切除术、经脐单孔腹腔镜手术相关学术论文在国际性及国家级学术会议上宣读交流，得到国际、国内同行的高度认可。腹腔镜肝切除术为我科率先在省内施行，且为目前省内实施例数最多、技术最成熟的单位，无论是腹腔镜左肝切除术还是腹腔镜右肝切除术均已常规开展用于治疗肝脏良、恶性疾病。腹腔镜下胆道探查术已完成逾千例，为省内完成例数最多单位，腹腔镜下软镜、硬镜结合及胆道镜、十二指肠镜双镜联合用于肝胆管结石病的治疗是我科特色技术。

肝胆胰外科以下技术处于国内先进、省内领先地位： 1）解剖性肝脏切除术在肝脏良恶性疾病治疗中的应用；2）以手术、介入及消融技术为代表的肝癌规范化综合治疗；3）腹腔镜技术在肝胆胰脾专科中的临床应用；4）个体化手术治疗复杂肝胆管结石；5）围肝门区域的解剖及临床应用；6）胆道血液供应的研究及临床应用；7）"早期集束化"治疗重症胰腺炎；8）保留脾脏的断流术联合分流术治疗门静脉高压症。

医院肝胆胰外科拥有省内临床诊治实力最为雄厚的团队。由１８位医师组成的医疗团队中，８位具备博士学位，７位具备硕士学位。以邵江华教授、邹书兵教授、邬林泉教授、黄明文教授为代表的学科骨干均为省内外享有盛誉的肝胆胰外科专家，在省内外肝胆胰外科领域拥有较大影响力。邵江华教授为我省普通外科领域唯一一位国家级百千万人才工程人选及国家有突出贡献中青年专家。本科室学科骨干的学术兼职有：中国抗癌协会肝癌专业学术委员会委员、中华医学会肠外肠内营养学分会委员、江西省抗癌学会副理长、江西省抗癌学会肝癌专业委员会副主任委员、中国医师协会外科医师分会全国委员、中国医师协会外科医师分会胆道外科医师委员会全国委员、全国医师定期考核内镜专业编辑委员会常务委员、江西省执业医师考试首席考官、江西省外科学会常务委员、江西省肝病学专业委员会常务委员、江西省外科学会肝胆外科学组组长、江西省外科学会腹腔镜学组成员、江西省人体器官移植技术临床应用专家组成员，学科骨干获得荣誉有：江西省“赣鄱英才555工程”领军人才、江西省政府特殊津贴、江西省百千万人才工程第一、二层次人选、江西省主要学科学术和技术带头人、江西省卫生厅“有突出贡献中青年专家”、江西省教育厅“高校中青年学科带头人”、江西省首届青年科学家、江西省教育厅“第七届师德标兵”、江西省教育厅“优秀研究生指导老师” 等。我科拥有两位博士生导师，也是省内唯一既可招收学术型又可招收专业型博士生的学科点。我科拥有的博士生导师及硕士生导师在省内肝胆外科中数量最多，每年培养的博士生、硕士生数量也在省内肝胆外科中数量最多。

近5年来，本科室承担国家自然基金6项、中央财政资助项目1项、教育部重点课题1项、卫生部专项基金课题2项，省厅级重点课题5项，省级课题20余项，科研经费高达５00余万。发表SCI论文8篇，CSCD核心库论文10余篇。