南昌大学第二附属医院感染性疾病科是在原江西医学院传染病教研室的基础上组建，成立于2005年，2015年新住院部起用，病床40张，标志感染性疾病科全面建成。经过10年的发展初具规模，医、教、研达到全国感染性疾病界领先行列，承担各种感染性疾病,如病毒性肝炎、感染性腹泻等各种传染病的诊治工作，尤其是重症肝炎的新型人工肝治疗，取得良好的治疗效果；年均门诊量3万人次以上，出院病人每年1800人次以上，平均住院天数7.8天，为感染性疾病的归口管理、及时有效治疗及控制各种传染病尤其是各种烈性传染病，保护人民群众的健康打下了良好的基础。科室于2003年即成为南昌大学传染病学硕士学位授予点，在科研、教学、临床等方面蓬勃发展。

在科研上，2016年获得1项国家自然科学基金项目，实现国家自然基金支助零的突破，主持省级课题10余项；在教学上，主持参与10余项教改课题，获得教育部教学成果奖二等奖1项，南昌大学教学成果奖一等奖2项，二等奖1项，我科孙水林教授建设的《无处不在-传染病》慕课在东西部高效课程共享联盟于2014年6月正式上线，为南昌大学首个在东西部高效课程联盟上线的科目；感染科目前有在职医师9人，其中主任医师/教授2人，副主任医师3人，主治医师2人，具有博士学位2人，硕士学位5人。科室擅长各型病毒性肝炎的诊治，慢性乙肝、丙肝的抗病毒治疗达到全国领先水平，以及各种疑难感染性疾病的诊治，尤其是重型肝炎的新型人工肝治疗。