小便的时候尿道刺痛可能是尿道炎或尿道结石所引起。如果尿道内存在炎症感染,会对尿道黏膜造成刺激,就会引起排尿刺痛的症状,还伴有尿频、尿急、尿不尽等症状,可通过尿常规以及尿液培养检查确诊,然后使用抗感染的药物进行治疗。如果尿道内存在结石,在排尿时,结石可能会随着移动,会对尿道造成损伤,也会引起尿道刺痛,还伴有尿不尽、尿无力、尿分叉等症状。