肛门和阴囊中间长疙瘩可能是以下因素所导致:1、如果男性不注意生理卫生,可能会导致肛门与阴囊之间的毛囊孔堵塞引起毛囊炎,就会导致肛门与阴囊中间出现小疙瘩,一般还伴有轻度、瘙痒等症状。2、如果男性长期处于高温潮湿环境中,内裤也不透气,可能会导致肛门与阴囊中间细菌或真菌滋生,由于炎症的刺激,就会导致局部出现小疙瘩,通常还伴有红肿疼痛等症状。