龟头上有小水泡可能为包皮龟头炎或生殖器疱疹所引起。如果男性不注意龟头部位的卫生,经常不更换内裤,可能会导致龟头部位出现炎症感染,由于炎症的刺激,就会导致龟头上出现小水泡,一般还伴有疼痛,瘙痒等症状,在确诊以后,应当使用外用抗真菌或抗生素类的药物进行治疗。如果男性存在不洁的性生活,有可能被传染上生殖器疱疹,也会导致龟头上起小水泡。