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排便出血的原因多是肛门疾病以及肠道疾病导致。 肛门疾病多见于内痔、肛裂、肛瘘以及肛管癌，其便血多为鲜血，轻度手纸染血，稍重一些可见滴血，而痔疮严重的可见喷血、射血，常伴有肛门疼痛。其中肛瘘便血还要看瘘口外口的位置，如果贴近肛门，则出血与便相混。而肛管癌会出现排便困难，肛门堵塞感等症状，肛门指诊以及肛门镜检查可以对以上疾病进行鉴别。
肠道疾病比较繁多，放射性肠炎、溃疡性肠炎、肠克罗恩病、急性肠炎、肠内异物、孤立性直肠溃疡、癌等等，近肛门端肠病变便血多为鲜血或者血块，远段出血多为暗色血块，或者无肉眼血，需要显微镜下观察。
发生便血建议完善肛门以及肠镜检查，因为少数患者会同时患有肛门病变与肠内病变，容易误诊、漏诊。