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妊娠期急性脂肪肝的病因和发病机制尚未完全清楚，但目前多认为与胎儿线粒体脂肪酸代谢异常、孕妇体内激素水平变化等因素有关。此外，孕妇初次妊娠为双胎或多胎、营养不良、怀有男胎、饮食缺乏蛋氨酸、孕期使用四环素药物、接触毒物或发生病毒感染等因素，也可能是本病的诱因。
胎儿体内的长链3-羟酰基辅酶A脱氢酶发生变异后功能丧失，不能催化线粒体内的脂肪酸代谢，使大量脂肪酸通过循环进入孕妇体内，并在肝脏内蓄积，造成妊娠期急性脂肪肝。孕妇在怀孕期间，体内的孕激素、雌激素、生长激素和肾上腺皮质激素均会升高，导致脂肪酸代谢紊乱，加上孕期肝脏内糖原减少，更容易使游离的脂肪酸在肝内蓄积，造成妊娠期急性脂肪肝。