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目前的HPV疫苗仅限预防以上几种HPV亚型感染，并不能预防所有HPV类型的感染，预防范围更全面的疫苗还待开发。
孕妇不能接种HPV疫苗
理论上HPV疫苗是不会对怀孕造成不良影响的，因为它是一种灭活疫苗；目前也没有发现疫苗对孕妇和胎儿会产生不良影响。但是目前各国都还是不建议孕妇接种HPV疫苗，如果接种之后发现怀孕了也要停止接种，剩下的接种剂次在哺乳期之后再接种，以免疫苗产生不良影响。
接种HPV疫苗的观察时间
一般我们在接种任何疫苗之后，医生都会提醒我们要休息20分钟左右再离开，因为所有的疫苗都有引发晕厥的风险，HPV疫苗也不例外，所以每次注射HPV疫苗后应该注射地点观察15分钟，无不良反应之后再离开。
接种前不用检测HPV感染
在接种HPV疫苗之前检测是否有HPV感染的意义不大，因为HPV病毒有很多亚型，而女性同时感染多种HPV的可能性并不多，现有的疫苗其实可以预防多种HPV感染，所以即使你感染了其中一种病毒的亚型，接种HPV疫苗还可以继续预防其他的病毒亚型和增加感染亚型的抗体。
疫苗接种后不能终身免疫
在接种HPV疫苗后的4-5年仍然会有保护效力，但是这种疫苗应用的时间比较短，是否能长期甚至终身有效还无法验证。所以已婚或者有性生活的女性即使在接种疫苗之后还需要定期进行宫颈癌筛查，以尽早发现宫颈癌变和癌前病变。
其他
对蛋白和酵母过敏者不建议注射HPV疫苗；注射疫苗前一周有发烧症状暂缓注射。